Sinopse: A longa guerra entre o planeta Terra e os homens-máquina finalmente terminou, resultando em uma paz que é mais uma vitória para os homens-máquina do que a Terra. Warrius Zero perdeu sua família na guerra para os homens das máquinas, mas, apesar disso, ele ainda é um membro da frota terrestre que agora está trabalhando em conjunto com os homens das máquinas. Sua nave, composta de humanos e homens de máquinas, recebeu uma tarefa quase impossível: capturar o pirata espacial Capitão Harlock. Enquanto Zero luta para realizar essa tarefa, começam a surgir evidências de que a paz entre homens-máquina e a Terra pode não ser o que parece ...