Sinopse: Dizem que "The Shepherd", uma lenda urbana da Academia Shiomi, aparece diante de estudantes esforçados para lhes conceder um desejo.
Enquanto está envolvido em um livro dentro da renomada Biblioteca Grande da escola, Kyoutarou Kakei, um estudante do segundo ano e presidente de fato do Clube da Biblioteca, recebe um e-mail do Shepherd prevendo um evento que mudará seu destino. Preocupado com a mensagem, Kyoutarou corre para uma estação de trem próxima e encontra o colega Tsugumi Shirasaki, a quem ele salva de ser atropelado por um trem de descarrilamento. Grato por suas ações heróicas, Tsugumi se junta ao Clube da Biblioteca e convida Kyoutarou a participar de seu misterioso "Projeto Feliz Shiomi". Juntamente com outros novos membros do clube, eles se esforçam para tornar a academia um lugar melhor e descobrir a identidade do enigmático pastor.