Sinopse: Katsuhira Agata é um adolescente quieto e reservado, cuja sensação de dor praticamente desapareceu. Seu amigo, Chidori Takashiro, só se lembra fracamente dos dias anteriores a Katsuhira sofrer essa profunda mudança. Agora, seu comportamento abafado e complacente faz de Katsuhira um alvo constante para os agressores, que o exploram por grandes quantias de dinheiro. Mas seus punhos apenas conseguem fazê-lo piscar, pois até as emoções estão longe de seu alcance. No entanto, um dia Katsuhira, Chidori e outros quatro adolescentes são sequestrados e forçados a ingressar no Sistema Kizuna como "Kiznaivers" oficiais. Os participantes estão conectados através da dor: se um membro é ferido, os outros sentirão uma quantidade igual de agonia. Esses indivíduos devem se tornar ratos de laboratório e bodes expiatórios de um sistema incompleto projetado com a paz mundial em mente. Com seus destinos literalmente entrelaçados, os Kiznaivers devem se expor um ao outro, ou correr o risco de fracassar muito mais do que apenas o Sistema Kizuna.