Sinopse: Ocorrendo um ano antes dos Zentraedi chegarem à Terra, Macross Zero narra os dias finais da guerra entre o U.N. Spacy e o anti-U.N. facções. Depois de ser abatido pelo mais novo avião de combate anti-U.N., o ás do piloto Shin Kudo se encontra na remota ilha de Mayan, onde a tecnologia é quase inexistente. Enquanto Shin permanece na ilha para curar suas feridas, a tranquilidade da ilha é destruída por uma batalha que envolve o mais novo lutador da ONU - o VF-0.
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