Sinopse: Hana, uma estudante universitária trabalhadora, se apaixona por um homem misterioso que frequenta uma de suas aulas, embora ele não seja um aluno de verdade. Como se vê, ele também não é verdadeiramente humano. Em uma noite de lua cheia, ele se transforma, revelando que é o último lobisomem vivo. Apesar disso, o amor de Hana permanece forte, e os dois decidem começar uma família.
Hana dá à luz dois filhos saudáveis - Ame, nascido durante as chuvas, e Yuki, nascido durante a queda de neve - ambos possuindo a capacidade de se transformar em lobos, uma característica herdada de seu pai. Muito cedo, no entanto, a morte repentina de seu amante devasta a vida de Hana, deixando-a criar uma família peculiar completamente sozinha. O estresse de criar seus filhos de natureza selvagem em uma cidade densamente povoada, mantendo a identidade em segredo, culmina na decisão de se mudar para o campo, onde ela espera que Ame e Yuki possam viver uma vida livre dos julgamentos da sociedade. Wolf Children é a história comovente sobre os desafios de ser mãe solteira em um mundo moderno e implacável.