Sinopse: Mii Snowdon é deixada sozinha depois que seu pai desaparece enquanto investiga o misterioso pokemon em forma de letra chamado Unown. A única pista do desaparecimento de seu pai é uma caixa contendo vários ladrilhos. Enquanto brinca com essas peças, Mii deseja ver seu pai novamente, e esse desejo desperta os Unown - que convocam o lendário pokemon Entei, tipo leão, para agir como seu pai.
Enquanto isso, Satoshi vai para Greenfield com seu fiel companheiro de pokemon, Pikachu, para se encontrar com seus amigos, Kasumi e Takeshi. Quando alcançam a área, ficam chocados ao encontrar o local cristalizado. Eles aprendem rapidamente que os Unown são responsáveis por isso e que precisam ser derrotados para restaurar Greenfield à sua antiga beleza.
A situação se torna pessoal quando a mãe de Satoshi é sequestrada por Entei. Para descobrir por que sua mãe foi levada, Satoshi, junto com seus amigos e pokemon, deve viajar pela paisagem cristalizada para enfrentar Entei e os Unown.
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