Sinopse: Após um surto repentino de psicocinese em 0,1% da população, uma rápida transformação varreu o mundo. A habilidade divina de manipular a matéria remotamente transformou muitos detentores de poder em violência, incitando um longo período de revolta. Finalmente, após uma era caótica moldada pela ascensão e queda de regimes opressivos, os humanos psíquicos foram capazes de alcançar uma paz frágil isolando sua sociedade, criando um novo mundo vinculado por regras complexas.
Na cidade de Kamisu 66, Saki Watanabe, de 12 anos, acaba de despertar para seus poderes e fica aliviada por se juntar a seus amigos - a travessa Satoru Asahina, a tímida Mamoru Itou, a alegre Maria Akizuki e Shun Aonuma, um garoto misterioso quem Saki admira - na Sage Academy, uma escola especial para médiuns. No entanto, o mal-estar aparece quando Saki começa a questionar o destino daqueles incapazes de despertar para seus poderes, e as crianças começam a se envolver em assuntos secretos, como os rumores de que os Tainted Cats disseram para seqüestrar crianças.
Shinsekai yori conta a história única de Saki e seus amigos sobre a maioridade enquanto eles viajam para crescer em seus papéis na suposta utopia. Aceitar esses papéis, no entanto, pode não ser fácil quando confrontado com as verdades sombrias e chocantes da sociedade e com o caos iminente nascido do novo mundo.