Sinopse: Desde 1973, uma invasão de alienígenas na Terra conhecida como BETA levou a civilização humana à destruição. Para se defender dessa enorme massa de forças inimigas, a humanidade desenvolveu grandes armas humanóides chamadas Tactical Surface Fighters e as implantou em suas linhas de defesa em todo o mundo. No entanto, seus esforços poderiam apenas retardar a derrota iminente, e a humanidade foi forçada a abandonar as principais áreas do continente euro-asiático. Por 30 anos, eles foram pegos em uma guerra sem fim contra o BETA sem nenhuma esperança de vitória.
Agora em 2001, o Japão Imperial enfrenta dificuldades no desenvolvimento da próxima geração de caças de superfície táticos , que defende as linhas de frente do Extremo Oriente. A ONU propôs um programa de desenvolvimento conjunto entre o Japão Imperial e os Estados Unidos, como parte de sua unidade internacional de desenvolvimento mútuo da TSF, o Projeto Proeminência.
Yui Takamura (um piloto de superfície da Guarda Real Imperial do Japão) é responsável pelo projeto e parte para o Alasca. Enquanto isso, Yuya Bridges, também piloto de superfície do Exército dos EUA, segue para o mesmo destino.
Eles nunca tiveram nenhuma idéia de quão drasticamente o encontro deles mudaria seus destinos.
Essa história de dilema interno ocorre durante o desenvolvimento dos novos caças de superfície táticos, as armas mais cruciais e eficazes contra o BETA. E desta vez, as apostas são muito maiores do que um punhado de vidas e nossa sanidade.
Tudo o que podemos fazer é lutar.
(Fonte: site oficial em inglês do Muv-Luv Total Eclipse, editado)